Ich kann nicht nachvollziehen was du damit sagen willst.
Den Renamer steuert man entweder über Django an oder über die Console.
Wie hier.
Was ich sicher weiß das auf einer Ordentlichen Installation auch Leere Ordner verschwinden … das weiß ich weil ich mal ziemlich umgekrempelt habe bei mir und sich die ganze Struktur verschoben hat usw.